故事讲述居住在一个破旧公寓中的，虽然贫穷但却很快活的3个美少年大学生竹本、真山、森田面前出现了一位如同小姑娘般的新生花本はぐみ，面对花本はぐみが尚无感觉到自身恋情的竹本，和被牵扯进奇怪气氛中的森田，另一方面真山也尚为察觉…

地球上的人类的安危被来自冥王星的巨大陨石Tanatos(希腊神话)所威胁着。为了对抗Tanatos，人类以国际太阳系开发机构“ISDA”为发足点，秘密进行着一向不为人知的开发计划，这个计划被命名为“D计划”，这个计划的内容为利用在小笠原近海…