故事延续飞机失事后的67天，新的生还者和岛上居民陆续登场。在这神秘的岛屿，生还者学习着有关“其他人”和他们的历史。The Others的其中一人加入生还者的行列并且伤害他们。一场战争在“其他人”与生还者之间即将触发，生还者也制造与“…

艾伯拉姆斯透露了“企业号”下一步行动的信息：“作为《星际迷航》的一部续集，其野心并不仅是要成为一部让观众值得一看的电影，也不仅仅是另一部电影，而是应该让人们明白，《星际迷航2》中会加入了更多新的东西。在第一部里，我们更多…